Das unterm Polrad ist deine Ankerplatte und sieht so aus: http://www.motelek.net/bosch/stern_6v20_10_11w.png
da findest auch gleich die dazugehörigen Widerstände - mess die am besten mal durch ob da alles in Ordnung ist. Da sind für dich nur die Ohm-Werte interessant.
http://www.motelek.net/bosch/zuendung/zuendboxen.jpg
eine von den beiden obigen Bosch Zündspulen wirst du unterm Tank haben, richtig?
Genau UND Messschieber beißt sich bei solch hohen Genauigkeiten! Passen denn die Toleranzbuchstaben von Zylinder + Kolben überein?
Normalerweise ist da gar keine Dichtung zwischen Motorgehäuse und Seitendeckel verbaut. Die 1 oder 2 Aussparungen am Motorgehäuse wo die Kabel nach oben rausgeführt werden, sollten jedoch mit passenden Gummitüllen verschlossen sein!
Hast du denn noch ordentliche Kompression?
Probier mal dass du das "Regenproblem" gezielt herbeiführst. Also gezielt nacheinander an den gefährdeten Stellen (Dichtungen, elektrische Kontaktstellen, Vergaser, Zündung) "bewässern" (z.b. mit Pumpsprüher etc..).
Vielleicht kannst das Problem dadurch lokalisieren!
Check am besten den ganzen Kabelbaum durch. Sprich lose Kontakte, Kabelbrüche, kalte Lötstellen. Auch Zündschloss!
Bei deinem Regenproblem vermut ich irgendwas in der Elektrik.
Dein Beschleunigungsproblem hast du er seit du diese Gummidichtung zwischen ASS und Zylinder verbaut hast richtig? Reduziert die vllt deinen Ansaugquerschnitt? Von 10mm Durchlass bleibt nicht mehr viel übrig wenn da was reinsteht.
Ist halt doch ein ziemliches Rätselraten....
Wenn das alles nichts hilft musst du vllt mal eine andere Zündung und anderen Vergaser probieren.
Bei der Zylindermontage hat sich auch nichts verkantet dass da etwas undicht geworden ist? (über kreuz anziehen! - Anzugmomente stehen im "Arbeiten am Zweitaktmotor"!)
Schwimmerkammerdichtung bzw. obere Vergaserdichtung (!) kaputt?
Auspuff frei?
Überprüf das alles !gewissenhaft!
Dieses ganze Rätselraten bringt nämlich nichts, wenn sich z.b. dein Abstellerkabel durchgescheuert hat und irgendwo Massekontakt bekommt wenns feucht wird 
Gruß